Die Bahnstrecke Dresden–Werdau durchquert den Stadtteil Freital-Deuben und hat dort einen Haltepunkt, an dem die S-Bahn-Linie 3 (Dresden–Tharandt/Freiberg) und Regionalzüge von Dresden Richtung Zwickau und Hof halten.

Die Bahnstrecke ist gegenüber dem übrigen Geländeniveau angehoben, es existieren auf Gebiet des Stadtteils neben dem Fußgängertunnel zwei Straßenunterführungen an der Güter- und der Güterbahnhofstraße. Rechts der Hauptstrecke befinden sich Anschlussgleise für das Edelstahlwerk, früher waren diese Teil der schmalspurigen Potschappel-Hainsberger Verbindungsbahn bzw. der „DWIR“-Linie. Auf der anderen Seite gab es ein weiteres Industriegleis, genannt „DWIL“-Gleis, das die Glashütte und den Augustusschacht über die Deubener Kohlenbahn (heutiges Umspannwerk) an das Schienennetz anband.